포상자 선정은 공모와 추천방식으로 후보자를 선정한 뒤, 분야별 심사 및 추천위원회 심사(1단계),  교과부 종합심사(2단계), 교과부 공적심사(3단계)와 정부심의, 대통령 재가 등의 단계를 거쳐 최종 결정된다.

자격요건은 과학기술발전에 기여한 공적이 현저한 자로서 포상의 종류별로 훈장은 15년, 포장은 10년, 대통령표창은 7년, 국무총리 표창은 5년 이상의 경력을 가지고 있어야 한다.

포상후보자 선정은 공모방식과 추천방식으로 진행되며 그 중 공모방식은 포상후보자 추천공고를 통해 선정하게되며, 소속기관장, 과학기술관련 단체 또는 기관의 장(다만, 기관 또는 단체의 장은 본인을 추천할 수 없음), 기관을 달리하는 관련분야에 종사하는 3인 이상 연대만이 추천할 수 있다.

추천서류 접수는 온라인 접수를 원칙으로 하되, 우편접수도 가능하며,
온라인 접수는 한국과총 홈페이지(http://www.kofst.or.kr), 혹은 시상프로그램 홈페이지
(http://prize.kofst.or.kr)에서 가능하고, 우편접수는 한국과총, 한국연구재단, 한국산업기술진흥협회, 한국과학기술한림원 중 한 곳에 서류를 제출하면 된다. 접수기간은 1월 15일(화) 18시 까지이며, 우편으로 접수하는 경우에는 접수마감일 도착분까지 유효하다. 접수된 서류는 반환하지 않으며, 포상후보자 선정 시 개별 통보할 예정이다.

포상계획, 추천서식, 참고자료 등 구체적인 사항은 교육과학기술부 홈페이지(http://www.mest.go.kr) 및 접수기관 홈페이지에 게재한 ‘2013년 과학기술진흥유공자 포상 계획공고 및 추천서식’을 참조하면 되며, 문의는 교육과학기술부 과학기술문화과(02-2100-6865) 및 한국과총 과학확산팀(02-3420-1262)으로 하면 된다.